Используется препарат для дезинфекции помещений и поверхностей. При этом применяются либо аэрозоли, либо водные растворы. Наиболее часто йодистый хлор используется для обработки птицеводческих и животноводческих помещений, инвентаря, холодильных отсеков, червоводен, а так же участвует в обработке поверхности скорлупы яиц, вымени коров. В области ветеринарии препарат может использоваться для борьбы со стригущим лишаем.
Также допустимо использование препарата мелкокапельно, методом полива при особо тяжелых случаях следующих заболеваний: